A Ilha da Pólvora é formada por aluviões recentes. Possui nas bordas vegetação juncácea e no interior gramíneas e ciperáceas.
O antigo Paiol do exército ali existente, construído em 1854, sedia hoje o Eco-museu da Ilha da Pólvora.
O local abriga uma biodiversidade de animais e plantas, e representa uma porção de marisma altamente preservada devido ao isolamento.